Kontroversielle religiøse talere kan tvinge mænd og kvinder til at sidde adskilt, siger universitetsledere.
Universities UK, gruppen af vicerektorer, som omfatter Nottinghams professor David Greenaway, sagde, at kønsopdeling er acceptabel.
Men forkæmpere hævder, at vicekanslerne bakker op om sexisme og kønsapartheid.
Universities UK offentliggjorde en rapport, som præsenterer det hypotetiske tilfælde af en ultraortodoks religiøs taler, der kræver kønsadskillelse.
Det fortsætter med at sige, at seksuel adskillelse ville være acceptabel i dette scenarie, så længe kvinderne ikke er tvunget til at sidde bag mændene.
Universiteter i Storbritannien insisterer på, at de fremhæver juridiske forpligtelser, og at hver enkelt sag skal ses individuelt.
Rapporten følger en række nyere kontroverser.
I marts forbød UCL en islamisk gruppe, efter at den havde organiseret en formodet adskilt begivenhed. En måned senere undersøgte Leicester Uni påstået seksuel adskillelse ved en offentlig forelæsning arrangeret af det islamiske studentersamfund.
En rapport tidligere på året fra Student Rights, en gruppe for studenterligestilling, hævdede, at adskillelse ved studenterarrangementer var udbredt.
Nicola Dandridge, administrerende direktør for Universities UK, sagde: Vejledningen handler ikke om rettigheder eller uret ved at opdele en begivenhed efter køn. I stedet fremhæver den de juridiske og andre faktorer, som universiteter skal overveje, hvis de adresserer de særlige omstændigheder, der er beskrevet i dette casestudie.